ce安全网绿色资源分享

教程资讯|常用软件|安卓下载|下载排行|最近更新

软件
软件
文章
当前位置:首页行业软件健康医药 → Chromas(DNA序列分析软件)
Chromas(DNA序列分析软件)

Chromas(DNA序列分析软件)

v2.6.5官方版Chromas(DNA序列分析软件)下载评分:9.5
下载地址
  • 软件大小:3.1M
  • 软件语言:简体
  • 更新时间:2021-05-04 08:58:13
  • 软件类别:健康医药
  • 软件性质:免费\国产
  • 软件厂商:
  • 运行环境:WinAll
  • 软件等级:
  • 官方网址:
  • 软件介绍
  • 软件截图
  • 同类推荐
  • 相关文章

软件Tags:

Chromas是一款非常专业的dnf序列分析软件,通过Chromas可以打开ab1、scf、ztr格式的图谱文件,这样听起来是不是确实非常专业呢,还很实用的,功能是非常齐全的,这款软件的优势就是支持自动删除低质量序列和矢量序列,这也是用户最喜欢的地方,那这款软件还可以将图谱进行格式转换,是不是方便了许多呢,只要你有需要的功能,这款软件都可以满足你,所以不用担心这款软件功能少,至少你需要的软件里都有,所以放心使用就好了,操作起来也是非常简单的,无需任何复杂的操作,可以更加方便实用其他软件打开。

Chromas(DNA序列分析软件)

功能介绍

  1、从Applied Biosystems DNA测序仪打开.ab1色谱图文件。

  2、打开由其他序列发生器创建或从数据库检索的SCF和ZTR格式色谱图文件。

  3、保存为.scf或Applied Biosystems .ab1格式。

  4、打印色谱图,其中包含缩放或适合一页的选项。

  5、自动删除低质量序列(当质量数据可用时)或矢量序列。

  6、以纯文本,FASTA,FASTQ,EMBL,GenBank或??GCG格式导出序列,或使用基本编号格式化以进行演示。

  7、将序列以纯文本,FASTA或FASTQ格式复制到剪贴板,以粘贴到其他应用程序中。

  8、反转和补充序列和色谱图。

  9、通过精确匹配或最佳对齐搜索子序列。

  10、显示3帧中的翻译以及序列。

  11、复制色谱图部分的图像以粘贴到文档或演示文稿中。

  12、批处理,包括格式转换,带矢量删除的序列导出,批量打印和原始数据的批量导出。

  13、使用Nucleics Pty Ltd的PeakTrace RP组件增强.ab1文件,以提高峰值可读性并提取更多高质量的基础。

使用方法

  1、选择File菜单打开一个序列文件,或者直接通过Open打开。

  2、一般测序中一个反应大概能测的长度为800左右,由于荧光染料的干扰和机器性能,测序结果在最开始和最后面的时候有几十个碱基不准确,如下图中红框的部分。评判测序结果的时候可以忽略前50个和后50个碱基。

  3、我们通过工具栏的缩放工具,可以放大或者缩小整个视图:

  通过上图可以看出,不同碱基对应不同的颜色。

  4、通过工具栏的“Find'工具,可以查找某个序列:

  5、通过“File”菜单栏的Blast Search可以直接连接在线数据库,将序列进行Blast,省去了我们打开NCBI等数据库然后复制序列再比对的麻烦:

  点击OK之后出现如下界面,然后点击“View report”即可。

  6、Chromas还自带序列翻译蛋白质功能,点击“Options->Show Translations->All”显示三条蛋白质翻译序列。这里之所以显示三条,是因为Chromas不知道你的序列翻译的起始位点,所以如果你的序列是cDNA序列,那么这三条蛋白质序列中总有一条是你想要的,这在我们做蛋白质点突变的时候非常有用。当然如果你的是启动子等其他序列,这个功能是多余的。

  7、我们可以将序列导出,并且可以设置导出的间隔、分行、以及是否显示序号,下面的设置中代表每60个碱基一行。

  8、当然可能会有同学想说,如果我想把测序峰图放在文章中,我该怎么弄?Chromas没有存储为图片的选项,这时可能有同学就想用截图了,这里Chromas可以存储为PDF格式,在“File”里面选择Print 预览,然后选择PDF即可。

  导出来之后就得到PDF格式的峰图了,这是矢量图,可以无限放大。然后通过Photoshop做出所需要的图片。

展开内容

软件截图

下载地址

  • PC版

同类推荐

相关文章

用户评论

验证码:

请自觉遵守互联网相关政策法规,评论内容只代表网友观点,与本站立场无关!

最新评论

已有人参与,点击查看更多精彩评论

关于CE安全网 | 联系方式 | 发展历程 | 版权声明 | 下载帮助(?) | 广告联系 | 网站地图 | 友情链接

Copyright 2019-2029 cesafe.com 【CE安全网】 版权所有 蜀ICP备19039426号-2| 蜀ICP备19039426号-2

声明: 本站为非赢利性网站 不接受任何赞助和广告 所有软件和文章来自互联网 如有异议 请与本站联系 技术支持:ce安全网